到1997年，搜索引擎意識到網站管理員在促使他們的網站在搜索引擎中獲得更好的排名，甚至有些網站管理員大量地在他們的頁面中插入關鍵詞（今天的杭州網站優化中被稱為堆砌關鍵詞的手段，屬于黑帽優化的一種）。早期的搜索引擎，如Altavista或者infoseek，為了防止網站管理員 操控他們的排名二隊搜索算法進行了調整。

由于高的營銷價值有針對性的搜索結果，是有潛力的搜索引擎和搜索引擎優化服務提供商之間的矛盾關系。在2005年的年度會議AIRWeb對抗性信息檢索在網絡上，創建的討論和積極的網絡內容提供商的破壞性影響降到最低。

公司采用過于激進的技術可以得到他們的客戶網站從搜索結果中禁止。 2005年，據華爾街日報報道，交通電力公司，據稱用于高風險的技術并沒有透露這些風險向它的客戶。連線“雜志報道，同一家公司起訴的博客和搜索引擎優化Aaron Wall編寫有關的禁令。谷歌的Matt Cutts后來證實，谷歌在事實上禁止交通電力和它的一些客戶。

有些搜索引擎也達到了SEO行業，并經常在搜索引擎優化會議，聊天和研討會的贊助商和嘉賓。主要搜索引擎提供信息和指導，以幫助網站優化谷歌有一個Sitemaps計劃，以幫助站長學習，如果谷歌索引他們的網站上有任何問題，還提供了對谷歌流量的網站。兵工具箱提供了一種從網站管理員提交一個網站地圖和網絡訂閱源，使用戶能夠確定的抓取速度，有多少他們的搜索引擎已經索引頁。